Origine et propagation des maladies infectieuses aujourd’hui : changements technologiques et industrielles, mutations génétiques et résistances microbiennes

Jacques Simpore, Labiogene Conférence, 2015 ;

Introduction : A partir des bactéries thermophiles qui habitent les eaux thermales à plus de 70°C jusqu’aux micro-organismes psychrophiles (cryophiles) qui ont colonisé les glaciers et vivent à moins de 0°C , nous avons des microbes qui ont pu s’adapter à tous les aléas climatiques et qui résident dans les hautes pressions (les barophiles), qui survivent dans des environnements très salés (les halophiles), dans les fonds marins (bactéries chimiosynthétiques), dans les lieux arides (les bactéries polyextrêmophile) et dans des milieux acides (acidophiles) et alcalins (alcalophiles). 

Aujourd’hui avec les changements technologiques et avec la globalisation, nous voyageons en transportant les micro-organismes dans le monde, dans nos avions, dans nos bateaux, dans nos voitures. Désormais, dans nos villes, nous les avons partout : dans nos circuits d’eaux, dans nos toilettes, dans nos climatiseurs, dans nos frigidaires, dans nos assiettes... Jusqu’à les avoir par surcroît en nous-mêmes : dans nos viscères les plus profonds, les bonnes bactéries nous aident à digérer nos aliments tandis que les pathogènes comme les Shigella, les Escherichia coli, les Salmonelles, le vibrion du cholera, les Rotavirus, Adenovirus, Norovirus …[1] provoquent en nous des entéropathies. D’autres vont jusqu’à infecter nos poumons (bacille de Koch), nos appareils reproducteurs (VIH, HPV, Treponema pallium, Neisseria gonorrhoeae), le foie (HBV, HCV, HGV…) [2-3] notre système nerveux central (Toxoplasma gondii, Trypanosoma gambiense, αlfa herpès virus, virus de la rage) etc. De nos jours, les maladies infectieuses sont responsables de près de 17 millions de décès par an, ce qui représente un tiers de la mortalité mondiale [4]. Elles constituent 43 % des décès dans les pays en voie de développement. Cette morbidité risque de s’aggraver, compte tenu des changements climatiques provoqués par l’industrialisation des sociétés modernes qui créent et favorisent, par conséquent, une température idéale pour la prolifération et la propagation des microorganismes pathogènes sur la planète terre. En effet, le smog et l’effet de serre provoqués par l’industrialisation, les diverses manipulations génétiques opérées par la biotechnologie et l’antibiothérapie abusive provoquent des mutations génétiques des microbes pathogènes. Ces modifications ontologiques de nos prédateurs leur offrent l’opportunité pour mieux s’adapter à notre environnement. En plus, l’élaboration industrielle des denrées périssables et leur transport dans le monde entier peuvent constituer des sources de diffusions des maladies infectieuses. Les objectifs de ce travail de recherche sont : (i) exposer en premier lieu les effets des changements technologiques qui favorisent la prolifération des agents pathogènes dans le monde, (ii) puis présenter les changements industriels comme cause de la recrudescence des maladies infec-tieuses et enfin, (iii) développer les défis des mutations génétiques, les adaptations microbiennes et leur implication dans la résistance aux médicaments.

Bibliographie :

1. Nitiema, L.W., et al., Burden of rotavirus and other enteropathogens among children with diarrhea in Burkina Faso. Int J Infect Dis, 2011. 15(9) : p. e646-52.

2. Simpore, J., et al., HCV and HIV co-infection in pregnant women attending St. Camille Medical Centre in Ouagadougou (Burkina Faso). J Med Virol, 2005. 75(2) : p. 209-12.

3. Network of sexual contacts and sexually transmitted HIV infection in Burkina Faso ; V Latora, A Nyamba, J Simpore, B Sylvette, S Diane, B Sylvere, et al., Journal of medical virology 78 (6), 724-729

4. Karou, S.D., et al., [Evolution of antibiotic-resistance Staphylococcus aureus in Saint Ca-mille Medical Centre in Ouagadougou]. Med Trop (Mars), 2010. 70(3) : p. 241-4.
5. AFSSA, Recommandations sanitaires vis-à-vis des aliments. 1995 : France.

6. Effective program against mother‐to‐child transmission of HIV at Saint Camille Medical Centre in Burkina Faso ; J Simporé, V Pietra, S Pignatelli, D Karou, WMC Nadembega, D Ilboudo et al,. Journal of medical virology 79 (7), 873-879

7. Klibi, N., et al., Antibiotic resistance and mechanisms implicated in clinical enterococci in a Tunisian hospital. J Chemother, 2006. 18(1) : p. 20-6.

8. Akujobi, C.N., Antimicrobial susceptibility pattern of Klebsiella species from Ebonyi State University Teaching Hospital Abakaliki, Nigeria. Niger J Clin Pract, 2005. 8(2) : p. 90-3.

9. Kacou-N’douba, A., et al., [Evolution of Streptococcus pneumoniae antibiotic resistance in Abidjan : update on nasopharyngeal carriage, from 1997 to 2001]. Med Mal Infect, 2004. 34(2) : p. 83-5.

10. Akoua Koffi, C., et al., [Nasal carriage of meticillin-resistant Staphylococcus aureus among health care personnel in Abidjan (Cote d’lvoire)]. Dakar Med, 2004. 49(1) : p. 70-4.

11. David Trystram, E.V., Yves Péan, Réseau européen de surveillance de la résistance bactérienne aux antibiotiques (EARSS) : résultats 2002, place de la France, in BEH Résistance aux antibiotiques. 2004. p. 2.

12. Diaz, M.A., et al., Plasmid-mediated high-level gentamicin resistance among enteric bacteria isolated from pet turtles in Louisiana. Appl Environ Microbiol, 2006. 72(1) : p. 306-12.

13. Gebreyes, W.A. and C. Altier, Molecular characterization of multidrug-resistant Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium isolates from swine. J Clin Microbiol, 2002. 40(8) : p. 2813-22.

14. Daly, M., et al., Molecular characterization of Irish Salmonella enterica serotype typhimurium : detection of class I integrons and assessment of genetic relationships by DNA amplification fingerprinting. Appl Environ Microbiol, 2000. 66(2) : p. 614-9.

15. Friedman L, A.J., Silverman JA, Genetic changes that correlate with reduced susceptibility to daptomycin in Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother, 2006. 50(6) : p. 8.

16. Ferrandiz MJ, A.C., Linares J, et al, New mutations and horizontal transfer of rpoB among rifampin-resistant Streptococcus pneumoniae from four Spanish hospitals. Antimicrob Agents Chemother, 2005. 49(6) : p. 8.

17. Enright, M., et al., Molecular evolution of rifampicin resistance in Streptococcus pneumoniae. Microb Drug Resist, 1998. 4(1) : p. 65-70.

18. Oelschlaeger, P., S.L. Mayo, and J. Pleiss, Impact of remote mutations on metallo-beta-lactamase substrate specificity : implications for the evolution of antibiotic resistance. Protein Sci, 2005. 14(3) : p. 765-74.

19. Oelschlaeger, P., R.D. Schmid, and J. Pleiss, Modeling domino effects in enzymes : molecular basis of the substrate specificity of the bacterial metallo-beta-lactamases IMP-1 and IMP-6. Biochemistry, 2003. 42(30) : p. 8945-56.

20. Abraham, E.P. and E. Chain, An enzyme from bacteria able to destroy penicillin. 1940. Rev Infect Dis, 1988. 10(4) : p. 677-8.

21. Oelschlaeger, P. and S.L. Mayo, Hydroxyl groups in the (beta)beta sandwich of metallo-beta-lactamases favor enzyme activity : a computational protein design study. J Mol Biol, 2005. 350(3) : p. 395-401.

22. Plasma homocysteine concentrations in a healthy population living in Burkina Faso ; J Simporè, S Pignatelli, S Barlati, M Malaguarnera, S Musumeci ; Current therapeutic research 61 (9), 659-668

23. Glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency and sickle cell disease in Burkina Faso. J Simpore, D Ilboudo, K Damintoti, L Sawadogo, E Maria, S Binet et al., Pakistan journal of biological sciences : PJBS 10 (3), 409-414

24. Biological and clinical presentation of patients with hemoglobinopathies attending an urban hospital in Ouagadougou : confirmation of the modification of the balance between Hb S and Hb C in Burkina Faso ; J Simpore, S Pignatelli, S Barlati, S Musumeci ; Hemoglobin 26 (2), 121-127

25. Modiano, D., et al., The lower susceptibility to Plasmodium falciparum malaria of Fulani of Burkina Faso (west Africa) is associated with low frequencies of classic malaria-resistance genes. Trans R Soc Trop Med Hyg, 2001. 95(2) : p. 149-52.

26. Kagone, T.S., et al., A variant of DC-SIGN gene promoter associated with resistance to HIV-1 in serodiscordant couples in Burkina Faso. Asian Pac J Trop Med, 2014. 7S1 : p. S93-6.

27. Malaguarnera, L., et al., Plasma levels of interleukin-18 and interleukin-12 in Plasmodium falciparum malaria. Parasite Immunol, 2002. 24(9-10) : p. 489-92.

28. Zeba Boukaré, S.J., Nacoulma Odile G. et al, Prevalence of blaSHV genes in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae at Saint Camille medical Center in Ouagadougou. Isolation of blaSHV11-like gene. African Journal of Biotechnology 2004. 3(9) : p. 3.

29. Zeba B., S.J., Nacoulma O.G, Production périplasmique de β -lactamases par des isolats cliniques. Antibiotiques 2005(7) : p. 7.

30. Zeba Boukaré, S.J., Nacoulma Odile G., et al., Identification of metallo-b bb b-lactamase from a clinical isolate at Saint Camillle medical Center of Ouagadougou/ Burkina Faso. African Journal of Biotechnology 2005. 4(3) : p. 2.

31. Nadembega, W.M., et al., Characterization of drug-resistance mutations in HIV-1 isolates from non-HAART and HAART treated patients in Burkina Faso. J Med Virol, 2006. 78(11) : p. 1385-91.

32. Simpore, J., et al., Reduction of mother-to-child transmission of HIV at Saint Camille Medical Centre in Burkina Faso. J Med Virol, 2006. 78(2) : p. 148-52.

33. Sagna, T., et al., Prevention of mother-to-child HIV-1 transmission in Burkina Faso : evaluation of vertical transmission by PCR, molecular characterization of subtypes and determination of antiretroviral drugs resistance. Glob Health Action, 2015. 8 : p. 26065.

34. Kagone, T.S., et al., Characterization of HIV-1 genotypes and antiretroviral drug-resistance mutations among patients in Burkina Faso. Pak J Biol Sci, 2011. 14(6) : p. 392-8.

35. Bonfiglio, G., et al., Epidemiology of bacterial resistance in gastro-intestinal pathogens in a tropical area. Int J Antimicrob Agents, 2002. 20(5) : p. 387-9.



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